Персонажем игры Clumsy Ninja является неопытный боец, натренировать которого и предстоит игроку. Девушка главного героя была похищена, и теперь ей угрожает опасность. На воина возложена ответственная миссия – найти и спасти похищенную возлюбленную, но недостаток умений ставит под сомнение успех предприятия.
Пользователю необходимо воздействовать на персонажа, чтобы заставить его выполнять необходимые действия: драться, прыгать на батуте, летать на воздушных шарах и многое другое. Игра имеет более 90 разнообразных уровней, красочную, детализованную графику и лёгкое управление. Персонаж моментально реагирует на действия игрока, меняется выражение его лица и движения, что позволяет полностью погрузиться в игру.