В игре Эволюция видов 2, пользователю предстоит зародить живой микроорганизм, и пройти вместе с ним по пути развития. Для начала своего эксперимента можно выбрать любую планету, из предложенных в игре, на которой и будет существовать новый живой организм. После успешного создания существа, необходимо помочь ему выжить, научить находить пропитание и защищаться. В ходе исследования и изучения окружающего мира, у живого организма формируются необходимые для существования навыки, а по мере прохождения игры открываются новые возможности для развития.