В двухмерном экшне Clone Armies игроку предстоит взять на себя командование небольшой армией, которая противостоит вражеским войскам. Солдаты вооружены разнообразным огнестрельным оружием, от пистолетов до мощных гранатомётов. Обе армии снабжены военной техникой, для проведения масштабных танковых баталий. Но ни одна армия не может обойтись без бойцов – во время сражения, на поле для работает машина для клонирования солдат. В игре есть несколько режимов, большое разнообразие юнитов и сюжетных миссий.